医院信息系统细分可以包括四类子系统：

行政管理系统：包括财务管理系统，人事管理系统，药库管理系统，医疗设备管理系统，后勤管理系统，门诊、手术及住院预约系统，病人住院管理系统（PAS）等。

医疗管理系统：包括门诊，影像文件系统（PACS、RIS），急诊管理系统（HIS），临床信息系统(CIS)，病案管理系统(EMR)，血库管理系统等医疗统计系统。

决策支持系统：包括医疗质量评价系统，医疗质量控制系统等。

各种辅助系统：如医疗情报检索系统，医疗数据库系统等。

HIS：医院信息管理系统（ Hospital Information System）。主要利用计算机软硬件、网络通讯等现代化技术手段，对医院及其所属各部门的人流、物流、财流进行综合管理，并对在医疗活动阶段中产生的数据进行采集、存储、处理、提取、传输、汇总、加工，生成各种信息，从而为医院的整体运行提供全面、自动化的管理及各种服务。

CIS：临床信息系统（Clinical Information System）。它是支持医院医护人员的临床活动，收集和处理病人的临床医疗信息，丰富和积累临床医学知识，并提供临床咨询、辅助诊疗、辅助临床决策，提高医护人员的工作效率，为病人提供更多、更快、更好的服务。像医嘱处理系统、病人床边系统、医生工作站系统、实验室系统、药物咨询系统等就属于CIS范围。

临床信息系统CIS相对于医院信息系统HIS而言，是两个不同的概念。HIS是面向医院管理的，是以医院的人、财、物为中心，以重复性的事物务处理为基本管理单元，以医院各级管理人员为服务对象，以实现医院信息化管理、提高医院管理效益为目的。而CIS是面向临床医疗管理的，是以病人为中心，以基于医学知识的医疗过程处理为基本管理单元，以医院的医务人员为服务对象，以提高医疗质量、实现医院最大效益为目的。

LIS：实验室信息管理系统(Laboratory Information Management System,)，是专为医院检验科设计的一套信息管理系统，能将实验仪器与计算机组成网络，使病人样品登录、实验数据存取、报告审核、打印分发，实验数据统计分析等繁杂的操作过程实现了智能化、自动化和规范化管理。有助于提高实验室的整体管理水平，减少漏洞，提高检验质量。

EMR：电子病历（EMR,Electronic Medical Record）也叫计算机化的病案系统或称基于计算机的病人记录（CPR,Computer-Based Patient Record）。它是用电子设备（计算机、健康卡等）保存、管理、传输和重现的数字化的医疗记录，用以取代手写纸张病历。它的内容包括纸张病历的所有信息。美国国立医学研究所将定义为：EMR是基于一个特定系统的电子化病人记录， 该系统提供用户访问完整准确的数据、警示、提示和临床决策支持系统的能力。

PACS：影像归档和通信系统（Picture Archiving and Communication Systems）。它是应用在医院影像科室的系统，主要的任务就是把日常产生的各种医学影像（包括核磁，CT，超声，各种X光机，各种红外仪、显微仪等设备产生的图像）通过各种接口（模拟，DICOM，网络）以数字化的方式海量保存起来，当需要的时候在一定的授权下能够很快的调回使用，同时增加一些辅助诊断管理功能。它在各种影像设备间传输数据和组织存储数据具有重要作用。

RIS：放射科信息系统(Radiology Information System)，是医院重要的医学影像学信息系统之一，它与PACS系统共同构成医学影像学的信息化环境。放射科信息系统是基于医院影像科室工作流程的任务执行过程管理的计算机信息系统，主要实现医学影像学检验工作流程的计算机网络化控制、管理和医学图文信息的共享，并在此基础上实现远程医疗。

CAD：临床结构化文档，是IHE中的一个内容，跟前面的东西都不是一类。它定义了跨机构、跨系统的医疗文书信息交换的“文档结构”，不涉及交换文档的内容信息标准。

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